In Nederland is er geen geschil over de religieuze status en de aard van de Scientology Kerk door de regering. Door de jaren heen hebben zowel de uitvoerende macht als de rechtbanken erkenningen uitgegeven van Scientology als religie en de Scientology Kerk als een religieuze organisatie die religieuze diensten aan haar parochianen levert. De Scientology Kerk is geregistreerd als een religieuze organisatie en de Scientology Kerk is erkend als een rechtspersoon.
Ministeries in Nederland drukken hun erkenning van de Scientology religie uit door hoe ze met de Kerk, haar parochianen en geestelijken omgaan. Het Ministerie van Justitie verleent geestelijken van Scientology het recht om gevangenissen te bezoeken en hulp aan gevangenen te bieden; het Ministerie van Onderwijs verleent scientologen het recht om hun eigen scholen te vormen voor het onderwijzen van hun kinderen in overeenstemming met hun religieuze overtuigingen; en de Belastingdienst accepteert de status van Scientology als religie.
In 1991, in overeenstemming met de principes van religieuze gelijkheid en non-discriminatie werd een belastinginspecteur door zijn meerderen opgedragen om de inkomstenbelastingverklaring van een geestelijke van Scientology hetzelfde te behandelen als die van geestelijken van andere religies.
